Kuigi domeenid Bakterid, Arheia ja Eukarya põhinesid geneetilistel kriteeriumid , biokeemilised omadused näitavad ka seda, et arheed moodustavad prokarüootides iseseisva rühma ja et neil on omadused nii bakterite kui ka eukarüootidega. Nende tunnuste peamised näited on:
bakteriraku sein; peptidoglükaan Bakterite rakuseinad sisaldavad peptidoglükaani. Visuals Unlimited / T.J. Beveridge
valitsuse ootamatu kukutamine
membraanilipiidid Bakterid ja eukarüoodid toodavad glütserooli molekuliga estersidemetega seotud rasvhapetest koosnevaid membraanilipiide. Encyclopædia Britannica, Inc.
2. Rasvhapped: bakterid ja eukarüoodid toodavad membraani lipiidid mis koosneb rasvhapetest, mis on seotud ester seondub molekuliga glütserool . Seevastu arheedidel on eeter sidemed, mis ühendavad rasvhappeid glütserooli molekulidega. Ehkki vähesed bakterid sisaldavad ka eetriga seotud lipiide, ei ole leitud arteriid, mis sisaldaksid esteriga seotud lipiide.3. RNA polümeraasi keerukus: transkriptsiooni teostab igat tüüpi organismides ensüüm nimega RNA polümeraas, mis kopeerib DNA matriitsi RNA produktiks. Bakterid sisaldavad lihtsat RNA polümeraasi, mis koosneb neljast polüpeptiidist. Kuid nii arheidel kui ka eukarüootidel on mitu RNA polümeraasi, mis sisaldavad mitut polüpeptiidi. Näiteks sisaldavad arheede RNA polümeraasid rohkem kui kaheksat polüpeptiidi. Eukarüootide RNA polümeraasid koosnevad ka suurest arvust polüpeptiididest (10–12), kusjuures polüpeptiidide suhteline suurus on sarnane hüpertermofiilsele arheeaalsele RNA polümeraasile. Seetõttu sarnanevad arheaalsed RNA polümeraasid pigem eukarüootide kui bakterite RNA polümeraasidega.
4. Valgusüntees: valgusünteesi erinevad omadused arheedes on sarnased eukarüootide omadele, kuid mitte bakterite omadustele. Silmapaistev erinevus on see, et bakteritel on initsiaator tRNA (ülekande RNA), millel on modifitseeritud metioniin, eukarüootidel ja arhetel on aga modifitseerimata metioniiniga initsiaator tRNA.
5. Ainevahetus: nii arheedes kui ka bakterites, sealhulgas eukarüootides, eksisteerivad mitmesugused ainevahetuse tüübid lämmastiku fikseerimine , denitrifikatsioon, kemolitotroofia ja hüpertermofiilne kasv. Metanogenees (metaani tootmine metaboolse kõrvalproduktina) toimub ainult Archaea domeenis, täpsemalt Euryarchaeota alarajoonis. Klassikaline fotosüntees klorofülli kasutamist pole ühestki arheiast leitud.
millised riigid panamakanali ehitasid
Arheede poolt kasutatavad metaboolsed strateegiad arvatakse olevat erakordselt suured mitmekesine looduses. Näiteks näib, et halofiilsed arheed suudavad areneda kõrge soolasisaldusega keskkondades kuna neis on spetsiaalne ensüüme kodeeriv geenide komplekt ainevahetusraja jaoks, mis piirab osmoosi. See metaboolne rada, mida nimetatakse metüülaspartaadi rajaks, esindab ainulaadset tüüpi anapleroosi (metaboolsete vaheühendite varude täiendamise protsess; antud juhul on vaheühendiks metüülaspartaat). Halofiilsed arheed, sealhulgas Haloarcula marismortui Arvatakse, et teaduslikes uuringutes kasutatud näidisorganism on omandanud metüülaspartaadi raja ainulaadse geenide komplekti horisontaalse geenisiirdena tuntud protsessi kaudu, kus geenid edastatakse ühest liigid teisele.
